A Santista Ambiental dispõe de toda uma logística para retirada de resíduos sólidos e líquidos de pequenas embarcações e navios fundeados ou atracados nos portos. Os principais resíduos de embarcações e navios são:

Resíduos líquidos sanitários; Resíduos sólidos contaminados com óleo resultante da manutenção do navio (embalagens, panos, estopas, trapos, papelões, papéis, serragens e EPI’s impregnados);

Resíduos líquidos oleosos (mistura de água de condensação com óleo combustível); Resíduos sólidos de Taifa (cozinha, refeitório e varredura).

Os resíduos sólidos gerados após serem coletados, são segregados, acondicionados, transportados e destinados corretamente.